GEM, un champ de forces ab initio : développement et perspectives

Jean-Philip Piquemal, National Institute of Environmental Health Sciences, Mail Drop F0-08, North Carolina, U.S.A.


Lundi 19 janvier 2006, 14h00, salle 2/3, Bâtiment St.Raphael, 3 rue Galilée, 94200 Ivry-sur-Seine
Dans cet exposé, nous discuterons des évolutions récentes du potentiel modèle SIBFA (Sum of Interactions Between Fragments Ab initio computed), champ de forces dédié à l'étude de métalloprotéines. Sa fusion, dénommée G.E.M (Gaussian Electrostatic Model), avec des algorithmes de Density Fitting sera présentée. Dans ce schéma de calcul utilisant une approche density fitting, des densités électroniques représentées par une matrice densité peuvent être projetées sur une base de gaussiennes auxiliaires. Cette reformulation de la densité permet d'obtenir un jeu de coefficients capables de reconstruire et de manipuler dans l'espace la densité de charge d'une molécule. L'approche GEM utilise ces nouveaux objets et calcule des énergies d'interaction intermoléculaires dans l'esprit des méthodes de décomposition d'énergie intermoléculaires (CSOV, SAPT) en recalculant séparément les diverses composantes.
L'utilisation de densités électroniques permet au champ de forces de réaliser une évaluation très rapide des intégrales cinétiques, de recouvrement et de répulsion électronique facilitant ainsi les approches QM/MM. Le modèle présente actuellement une précision de l'ordre de 1% sur son niveau de référence ab initio (HF, DFT, MP2 ou CCSD) et est notamment performant sur les métaux. Les stratégies d'implémentation haute performance de l'approche mettant en jeu des méthodes de type Particle Mesh Ewald seront abordées dans l'optique de la dynamique moléculaire et du QM/MM.