Calcul des interactions inter- et intramoléculaires à
l'aide d'une approche de mécanique moléculaire polarisable.
Etude des effets de la nonadditivité, comparaison avec les
calculs ab initio et applications à des complexes d'interet
pharmacologique
Nohad Gresh,
Faculté de Pharmacie, Paris
e-mail:gresh@bisance.citi2.fr
Lundi, 21 février 2000, 14h30
Afin de tester et de valider la methode de mécanique moléculaire SIBFA,
de nombreuses comparaisons ont été effectuées avec les resultats de
calculs ab initio supermoléculaires, dont certaines seront presentées
ici. Ces tests portent principalement sur: a) des complexes polycoordinés
de Zn2+; b) des complexes stabilisés par des liaisons hydrogène multiples.
De tels complexes ont un caractère nonadditif très important,
généralement
anticooperatif pour a) et cooperatif pour b). La methode SIBFA parait
capable de rendre compte de l'essentiel des effets nonadditifs dus aux
termes de polarisation et de transfert de charge.
Le problème de la transferabilité des multipoles est abordé,
problème qui se pose lors de la construction de grandes molécules
flexibles à
partir de leurs fragments constitutifs, ainsi que le problème du portage
de la fonction d'énergie inter-moléculaire au calcul des interactions
intra-moléculaires.
Certaines des applications de cette méthode, en cours ou en projet, à des
problèmes d'interet pharmacologique seront enfin presentées: sites de
reconnaissance de metalloenzymes ou de proteines de signalisation, doigts
à Zinc, etc.
Une extension possible à la Chimie Supramoléculaire sera enfin
mentionnée.